A栋·基本陈列

A栋小楼原来是“普庆新村”的沿街商铺，在日军侵占南京时期，保留着底层商铺、上层居住和库房的格局。现展览着陈列馆的基本陈列《二战中的性奴隶——日军“慰安妇”制度及其罪行展》。该展览通过部分与“慰安妇”有关的历史照片、文物及幸存者的证言等展品，谴责日军在二战中推广罪恶的“慰安妇”制度，强迫广大妇女成为性奴隶，侵犯女性人权的罪行。

B栋·旧址陈列

这栋建筑物原为“普庆新村”的旅馆，原门牌号为利济巷2号。日军侵占南京后，该处被日军改造成“东云慰安所”，以朝鲜籍“慰安妇”为主。1938年起，朝鲜籍“慰安妇”朴永心曾在二楼19号房间被奴役三年。2003年11月21日，朴永心老人曾亲身来现场指认。现展览着陈列馆的旧址陈列《金陵梦魇——南京日军慰安所与“慰安妇”史实展》。

C栋·专题陈列

该四栋建筑物原为“普庆新村”的双拼住宅，原门牌号为利济巷18号。日军侵占南京后，日军将其改造成“故乡楼慰安所”，内住日本籍“慰安妇”，专门为日军高级军官提供性服务，南京居民也称其为“日本窑子”。现分别展览着陈列馆的专题陈列《沪城性奴泪——上海慰安所与日军“慰安妇”制度罪证展》《遍布中国的日军慰安所——中国“慰安妇”血泪记忆展》《伤痛记忆与控诉——来自朝鲜半岛的日军“慰安妇”受害史实展》《众多国籍的性奴隶——太平洋战争与日军“慰安妇”制度罪行展》。